在藥廠設計中，為了使動物實驗具有重復性，提高實驗精度，應盡可能地使整個籠具所處環境均勻，使動物房內各處的飼養條件盡可能地一致。而藥廠實驗動物房的氣流設計直接影響著室內溫、濕度及氣流速度的分布。
在藥廠設計中，單向流送風方式從保證潔凈度角度來看，往往被認為是潔凈室最理想的氣流組織形式。但實驗動物房的換氣次數小于20次/h，不屬于循環式大風量潔凈室，不能滿足單向流潔凈室對風速低于0.1m/s的要求，也不易保證氣流速度和溫、濕度的均勻分布，甚至會同時出現單向流式送風和非單向流式送風所存在的缺點。因此，實驗動物房如果采用單向流送風方式，飼養設施必須采用籠架。當飼養設施采用亞屏障系統和敞開系統時，送風方式宜采用非單向流式。在藥廠設計中，不采用單向流式送風有以下原因:
1）實驗動物的飼養是不分晝夜地、長期地，有的甚至長達幾年。因此，不能不考慮長期送風出現的污染積累和微生物繁殖問題。在飼養期間如果更換全部過濾器困難很大。如果不更換，則很難保證長時間、大面積送風的潔凈度。
2）工程上很少有采用全新風單向流送風方式的。因為，這種方式能耗大，運行費用高，一般很難接受。如果采用大量循環送風，又難避免污染物的積累和微生物的繁殖。
3）單向流送風方式會在上氣流和下氣流之間形成潔凈度和溫、濕度梯度。實驗動物房如果采用單向流送風方式，全室動物則不能在相同條件下飼養，這樣會影響動物實驗的結果。
在藥廠設計中，影響實驗動物房氣流分布的因素有:換氣次數、送風口面積和形狀、回風口數量和位置、籠具的種類和布置及房間的面積。由于影響氣流分布的因素很多而且動物是活動發熱體，組織好室內氣流比較困難。實驗動物房內籠具布置多為豎向，而且，多數情況下籠具堆積高度直達距頂棚60mm左右。這就要求空氣的溫度和濕度在垂直方向有良好的分布。對于一般動物，溫度偏差應小于±1攝氏度，濕度偏差應小于±10％。而且，應盡量減小直接吹向動物的氣流速度，籠具周圍的空氣流速應在0.15～0.25m/s范圍內。為了減小動物飼養環境的差別，可定期調換籠具的位置。
國外研究表明:采用設置在頂棚上的散流器送風口，設置在側墻上的回風口，而且，采用小面積房間，可以形成較好的室內氣流分布。我國現有實驗動物房基本遵循上述方案，送風口一般設置在頂棚上，回風口一般設置在側墻上距地50～60cm處，且多設置于四個墻角，或者至少設置在兩面側墻上。實踐證明:這樣的設計氣流組織效果較好。